Die Skelettstruktur eines Pinguins ist nach dem gleichen allgemeinen Muster aufgebaut wie andere Vögel. Ein offensichtliches Merkmal eines Vogelskeletts ist der Kiel oder das Brustbein. 

Diese ist sehr breit und flach gestaltet, liegt aber senkrecht zu den Rippen. Dieser große Knochen hilft, die Flugmuskeln und -sehnen zu befestigen, was sowohl in Form als auch in Funktion für den Flug sehr wichtig ist. Und da Pinguine durch das dichtere Wasser „fliegen“, sind auch sie auf die Kiel- und Flugmuskeln angewiesen, um sich fortzubewegen. 

Eine weitere wichtige Anpassung, die sich von anderen fliegenden (freiwilligen) Vögeln unterscheidet, ist die Dichte ihrer Knochen. Die meisten Vögel, die wir in unseren Gärten und in unserer Nachbarschaft fliegen sehen, haben Skelette mit hohlen Knochen. 

Dadurch entsteht ein extrem leichtes Skelett, das es den Vögeln ermöglicht, in den Flug abzuheben. Pinguine würden von Knochen dieser gleichen Dichte nicht profitieren. Pinguine müssen in der Lage sein, unter Wasser zu tauchen, um nach ihren Fischen zu jagen, und hohle Knochen würden sie zu schwimmfähig machen. 

Um dies zu unterstützen, sind Pinguinknochen fest und schwer, was ihnen hilft, mehr Gewicht zu geben, um tief zu tauchen.